Лаборатория гидробиологии создана во ВНИИПРХ в 1968 году под руководством доктора биологических наук, профессора, Богатовой Ирины Борисовны.
Важным стимулом развития гидробиологии являются интересы рыбной отрасли. В естественных водоемах это, прежде всего, изучение запасов рыб и их кормовых ресурсов. В исследованиях по массовому получению живых кормов в индустриальных условиях и стимулированию развития естественной кормовой базы в рыбоводных прудах в 60-70х годах основное внимание уделялось всестороннему изучению наиболее продуктивных видов гидробионтов и совершенствованию биотехники их культивирования.
В 80-е годы к перспективным направлениям исследований относились работы по массовому производству стартового живого корма для личинок рыб (науплиусов жаброногого рачка Artemia salina). Была разработана биотехнология массового получения науплиусов артемии.
В области прудового рыбоводства разработаны перспективные методы и способы повышения естественной рыбопродуктивности прудов. Разработано новое направление в гидробиологии – рыбоводная гидробиология.